十河一存や義興の死、安宅冬康の一件などは久秀が関係しているのではないかと噂されています。確かに、立て続いた不幸がすべて久秀の陰謀ととらえるのは無理があるかもしれません。ところが、長慶を孤立するように仕向けて死に追いやったと見た人は当時も一定数いたようです。

長慶の死後、養子である三好義継が14歳の若さで家督を継ぎますが、政治の実権は久秀が掌握。京都・奈良・堺という関西の主要都市を手中に収めてしまいます。

長慶の死をきっかけに、弱体化していた室町幕府第13代将軍の足利義輝が権力を復活させようとしますが、義継と、久秀の嫡男・松永久通、そして三好三人衆（三好長晩・三好政康・岩成友通）らが京に攻め入り、義輝を殺害。宣教師のルイス・フロイスは、『日本史』にて、「この事件の首謀者は久秀」と書き残しています。

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参考：海音寺 潮五郎『悪人列伝 近世篇』